线粒体被称为细胞的“能量工厂”,但其功能远不止ATP生成。近年来的研究表明,线粒体还参与细胞凋亡、代谢调控、免疫信号传导和氧化应激反应等关键生命过程。线粒体功能的实现依赖于数千种蛋白质之间的高度协同,而这些蛋白之间形成的蛋白互作网络(Protein-Protein Inter
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在真核细胞中,内质网(Endoplasmic Reticulum, ER)是蛋白质合成、折叠与质量控制的重要枢纽。大量分泌蛋白、膜蛋白以及折叠相关分子伴侣都在此完成关键加工步骤。当内质网功能异常时,往往会触发内质网应激(ER stress)和未折叠蛋白反应(UPR),进而参与多种疾病的发生发展,例如
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在过去十年中,随着高分辨质谱技术的发展,越来越多新型组蛋白翻译后修饰(PTMs)被系统鉴定。除乙酰化(acetylation)之外,丁酰化(butyrylation)逐渐成为表观遗传学研究的热点。作为一种来源广泛的短链脂肪酸(Short-chain fatty acid, SCFA),丁酸(buty
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在表观遗传学快速发展的今天,组蛋白翻译后修饰(Histone Post-Translational Modifications, PTMs)已成为解析基因表达调控机制的核心研究方向。从经典的乙酰化(Kac)、甲基化(Kme)到近年来发现的巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu),越来越多的新型酰化修饰正
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组蛋白 β-羟基丁酰化(β-hydroxybutyrylation, Kbhb)是一种新型赖氨酸翻译后修饰,与代谢状态密切相关,已被证实参与调控染色质结构与基因表达。组蛋白 β-羟基丁酰化修饰的丰度极低,且常与乙酰化、甲基化等其他修饰共存,极易被掩盖。高效、专一的样品前
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在表观遗传学研究不断深化的今天,组蛋白翻译后修饰(Histone Post-Translational Modifications, PTMs) 已成为解析基因表达调控机制的核心领域。传统研究聚焦于乙酰化(Acetylation)、甲基化、磷酸化等经典修饰,但近年来,一种新型代谢相关修饰&mdash
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组蛋白磷酸化是一种关键的翻译后修饰,广泛参与染色质结构调控、基因表达调节和DNA损伤响应。它通过引入负电荷改变组蛋白与DNA的相互作用,并与其他修饰形成表观遗传“密码”,进而决定染色质的开放或压缩状态。特定位点如H3S10和γ-H2AX,在细胞周期和应激反应中具有
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组蛋白磷酸化(Histone Phosphorylation)是表观遗传调控中的关键修饰方式之一。它通过改变染色质结构、招募调控蛋白或与其他组蛋白修饰协同作用,调节基因表达、DNA损伤修复和细胞周期进程等多种生物学过程。 一、组蛋白磷酸化的基本概念 组蛋白是一类带正电的碱性蛋白,DNA缠绕在其上形
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福尔马林固定石蜡包埋(FFPE, Formalin-Fixed Paraffin-Embedded)是组织样本长期保存的金标准,广泛应用于病理学和临床研究。然而,这种处理方式也为蛋白质组学分析带来了显著挑战,尤其是在蛋白酶切效率方面。 一、福尔马林固定的化学本质及其对蛋白结构的影响 1、甲醛交联机
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在组织样本保存中,福尔马林固定-石蜡包埋(FFPE)是一种广泛应用的标准方法,尤其在临床病理领域。然而,FFPE处理带来的蛋白质交联(crosslinking)现象,给后续的蛋白质组学分析带来了显著挑战。 一、什么是FFPE中的蛋白质交联? FFPE样本的核心处理步骤包括: 1、使用10%中性缓冲
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